Фото: wikimedia.org
Половину зібраних послідовностей ДНК не вдалося впізнати
Вчені також знайшли ДНК бактерій чуми.
Американські вчені 18 місяців проводили аналіз ДНК з різних станцій нью-йоркського метро і склали PathoMap - карту всіх мікроорганізмів підземки. Дослідники виявили більш як 15 типів живих істот, причому 48% ДНК не вдалося знайти відомого господаря. На центральних станціях виявилися сліди сибірської виразки і бубонної чуми.
Доктор Кріс Мейсон і його колеги брали мазки з турнікетів, квиткових кіосків, поручнів, перил, лавок, урн та інших поверхонь всіх станцій найбільшої системи підземного транспорту в світі. У підсумку вони зібрали понад 10 мільярдів одиниць аналізу, які обробив суперкомп'ютер.
Загальні результати дослідження вселяють оптимізм: великої загрози заразитися (або необхідності носити захисні рукавички) вчені не виявили. Більшість з 637 відомих бактерій, вірусів, грибів і тварин, чиї ДНК присутні в підземці, не є патогенами - це нешкідливі мешканці організму людини (шкіри і травного тракту насамперед).
Однак 12% бактерій виявилися пов'язаними з хворобою. На 27% поверхонь знайшли живі антибіотикорезистентні мікроби. Також вчені виявили дві проби з фрагменти ДНК Bacillus anthracis (збудника сибірської виразки) і три - з плазмидами Yersinia pestis (збудника бубонної чуми). Втім, експерименти показали, що це ДНК виключно мертвих бактерій.
Вчених здивувало, що приблизно половину (48,6%) зібраних послідовностей ДНК не вдалося впізнати за основними базами даних США - мабуть, вони належать невідомим організмам.
Жіночі гаджети брудніші: вчені показали кількість бактерій на телефонах
Нарешті, лише 0,2% зразків пов'язані з геномом людини - хоча вчені працювали із зонами, де щодня проходить до 6 мільйонів людей.
За допомогою інструментів AncestryMapper і ADMIXTURE дослідники спробували відтворити демографічну картину станцій. Виявилося, що їхня карта відповідає даним перепису населення. Наприклад, в населеному китайцями районі біля Чайнатауна (на Манхеттені) виявилася суміш генів, характерних для мешканців східної Азії та Латинської Америки.