Вчені досліджували десятки коронавірусів
Мікробіологи побудували древо еволюції найближчих родичів коронавірусу нового типу і заявили про велику ймовірність повтору пандемії.
Вчені з'ясували, що предок вірусу SARS-CoV-2 відокремився від загального древа еволюції вірусів кажанів від 40 до 70 років тому. До такого висновку молекулярні біологи прийшли, порівнявши геноми найближчих родичів коронавірусу SARS-CoV-2. Їх висновки у вівторок, 28 липня, опублікував науковий журнал Nature Microbiology.
"Наш аналіз показує, що віруси, споріднені SARS-CoV-2, циркулюють серед підковоносих кажанів вже багато десятиліть. Ці віруси відрізняються великою універсальністю, що може пояснювати, як з'явилася епідемія COVID-19 і як щось подібне може статися в майбутньому", - йдеться в статті.
Мікробіологи вже довго намагаються зрозуміти, де і коли з'явився коронавірус нового типу - збудник хвороби COVID-19, а також те, коли він почав передаватися від людини до людини. Епідеміологи ще не прийшли до однозначної думки з цього приводу.
Зокрема, біологи поки не можуть точно сказати, де і коли виник вірус, які тварини були його проміжними носіями, і яку роль у його формуванні зіграла так звана рекомбінація - обмін генетичним матеріалом між різними типами коронавірусів.
Вивчаючи геноми шести дюжин найближчих сучасних родичів SARS-CoV-2, група молекулярних біологів під керівництвом професора Единбурзького університету (Велика Британія) Девіда Робертсона з'ясувала історію еволюції предків цього вірусу.
Для цього вчені розробили спеціальні алгоритми, за допомогою яких вони видалили з геномів цих патогенів всі сліди рекомбінації. Це потрібно було зробити, оскільки обміни фрагментами РНК між вірусами заважають вченим з'ясовувати родинні зв'язки між ними і визначати час їх появи, а також швидкість їх еволюції.
Обробивши геноми всіх вивчених вірусів подібним чином, вчені побудували древо еволюції найближчих родичів SARS-CoV-2. Потім вони спробували зрозуміти, коли він відокремився від ймовірного предка, вірусу RaTG13, що вражає підковоносих кажанів, які мешкають на півдні і південному сході Китаю.
Ці розрахунки підтвердили, що SARS-CoV-2 і RaTG13, дійсно, родичі. При цьому вчені з'ясували, що їх предки розділилися несподівано давно: залежно від методики аналізу генома і набору аналізованих ділянок РНК вірусів у 1948-му або в 1969 роках. Трохи пізніше розділилися предки збудника COVID-19 і атипової пневмонії SARS: у проміжку між 1952-м і 1970 роками.
Все це, як відзначають дослідники, говорить про те, що віруси, схожі на SARS-CoV-2, циркулюють серед кажанів Південного Китаю вже більше півстоліття. З огляду на особливу структуру їх оболонки, яка дозволяє їм приєднуватися до рецепторів на поверхні клітин легенів відразу декількох видів ссавців, це пояснює, чому в людську популяцію потрапили відразу два подібних віруси (SARS-CoV-1, збудник атипової пневмонії, і SARS-CoV-2 , збудник COVID-19) і викликали серйозні спалахи легеневих інфекцій.