Британські вчені розшифрували геном карликової берези

Генетики з Великобританії вперше розшифрували повний геном карликової берези.

Таким чином, вчені сподіваються зрозуміти, чому ці берези і їх "великі" сестри не здатні протистояти набігам жуків-вузькозлаток, які проникли в Європу та Азію з Північної Америки.

Як зазначив один з авторів відкриття Джеймс Боррелл з університету Королеви Марії в Лондоні, отриманий геном важливий для збереження популяції беріз у країні.

Група генетиків під керівництвом Річарда Баггса розшифрувала геном карликової берези, намагаючись знайти генетичні корені епідемії бронзових вузькозлаток в європейських березових гаях.

Ці комахи харчуються корою та іншими частинами стовбура беріз. Європейські та азіатські берези не мають стійкості до них, і їх проникнення на територію Британії та інших європейських держав стало причиною справжньої екологічної катастрофи.

Баггс і його колеги зібрали зразки клітин берези в північних районах Шотландії, витягнули з них генетичний матеріал і розшифрували його. Загалом геном карликової берези містить у собі 450 млн нуклеотидів - "літер" ДНК.

Автори статті відзначають, що за своєю якістю віртуальний геном берези не поступається аналогічним послідовностям для людини та інших організмів. Кожний нуклеотид був у середньому прочитаний 67 разів, що мінімізує число можливих помилок при секвенуванні генома.

Дослідники провели чорнове дослідження генома і виділили в ньому кілька підозрілих ділянок, які можуть впливати на здатність берези захищатися від нападів вузькозлаток.

Далі вчені планують порівняти їх з аналогічними фрагментами в геномах 15 інших видів беріз, і знайти причину уразливості.

Зазначимо, що раніше генетики розробили метод внесення змін в геном модельних тварин на пізніх стадіях розвитку.